Auteur-réalisateur, il signa plus de 500 émissions de télévision et de radio souvent novatrices. Précurseur du clip, il révolutionna le petit écran dans les années 1960 et 1970 avec des créations iconoclastes qui firent date dans l’utilisation de la vidéo, mettant en image de grands chanteurs comme Yves Montand, Gilbert Bécaud, Johnny Hallyday, Serge Gainsbourg (il mit notamment en image Histoire de Melody Nelson) ou Juliette Gréco.

Défendant « un art de l’imagination », Jean-Christophe Averty avait débuté à la Radio-télévision française dans les années 1950, avant de se faire remarquer au cours de la décennie suivante avec « Les Raisins verts », une émission provocante, puis avec « Douches écossaises », « Au risque de vous déplaire » ou « Show effroi ».

A la radio, il anima durant près de trente ans sur France Inter, puis France Culture l’émission Les Cinglés du music-hall, véritable entreprise de réhabilitation du patrimoine de la chanson française.

C’est bien au cimetière parisien de Bagneux (et non au cimetière communal) qu’il repose, dans la 84ème division.